La Gigabyte sin duda, tiene frecuencias mas altas y es mas barata y es una 1080, con lo cual rinde mas, aparte los ventiladores parecen mas silenciosos y mejores que los de la Asus.
Aunque mi sugerencia es que si puedes vayas a por la MSI Gaming, los ventiladores que lleva con el sistema Twin Frozr VI que tienen muy buen flujo de aire y son muy silenciosos. Además la MSI tiene frecuencias mas altas que la Gigabyte con lo cual te daria un poco mas de potencia, y son 80€ de diferencia solo.
He tenido malas experiencias con las graficas de 3 ventiladores, tuve una MSI GTX 970 Gaming y 0 problemas, y hace 2 dias me pillé la 1080 que te digo y lo mismo, va de perlas.