Creo que este tuto te puede venir bien.
http://forum.videohelp.com/threads/2580 ... AC3-Volume
Para sacar el AC3 usa el MKVExtract GUI que es uno de los programas que incluye las MKVTools.
Para ver la peli tal y como deseas "ejecutala" desde la carpeta TRANSCODE, lee varias paginas atras que le explique a un compañero 20 veces como hacerlo. Asi puedes ver la peli con o sin subs, en un idioma en otro.... etc...
