Geforce gtx 560 ti Instalacion

No lo sabemos, eso ya tendrás que buscar en el manual de la placa como se desactiva la integrada.

Si no das más datos y explicas mejor el problema va a ser muy difícil ayudarte.

¿Cuáles son todas las piezas de tu ordenador?
¿Qué fuente tienes (es lo principal)?
¿Le has conectado a la gráfica todos los conectores de alimentación.