Cortar MKV

tengo una pelicula en MKV, quisiera saber si se le puede cortar un trozo, porque al querer pasarlo a MP4, resulta ser que tiene un trozo mal ( 2 segundos ) y siempre se me para en ese punto, y quisiera cortar el trozo que esta mal y asi poder hacer la conversion sin problema.
Gracias
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eso ya lo he echo, y he probado varios programas, pero nada, he probado Yamb, splitter..., y nada, estos me parten en mp4 pero no en mkv y solo hacen bien partirlos por la mitad, pero un punto concreo no lo hacen, el mkvmerge, cuando comienza me sale un error y se para, o sea, que tampoco me sirve
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