Eso es para quitar con trucha la actualización, el error 001 y el error 002, por eso tienes que usar el GWP y demás pasos extra.
Digamos que los pasos que tienen que ver con el partition builder serían nada más el 9, 10 y 11.
En general, en teoría sería hacer los pasos:
1. Crea el Key.bin con el generador que trae WiiScrubber (pueden bajar la última versión, generador incluido, de la carpeta mediafire de mi firma).
2. Abre la ISO que quieres modificar con WiiScrubber
3. Selecciona la partición 2 - Data y extraela entera en un directorio
3.1 - Puede que necesites extraer algunos ficheros (Main.dol etc) por separado, manualmente, si no han sido extraidos ya.
4. Abre Partition Builder y abre todos los ficheros necesarios de sus respectivas localizaciones.
5. Cuando te pregunte por el "source", selecciona el directorio donde extragiste la partición 2.
6. Ahora dale a contruir (build) y espera a que termine de crear la patición.
7. Con WiiScrubber, pulsa con el botón derecho del ratón en la partición 2 - Data y elige reemplazar (replace).
8. Selecciona la partición que acabas de crear con Partition Builder y espera a que termine.
9. Ya puedes grabar la ISO y jugar con ella en la Wii.
Todo este proceso, evidentemente, utiliza firma trucha.
Imagino, que, en todo caso, eso es lo que ha estado haciendo Ernestito y no le ha funcionado ¿no es asi?