Ayuda con las isos

Hola amigos de la escene, necesito una ayuda o aclaratoria respecto a un tema. Primero que nada no soy ningun piratero ni nada por el estilo, solo saco copias de mis juegos para asegurar su buen estado y durabilidad.

Ahora aqui está el problema: Cuando hago un backup de los juegos mediante el riptool y el iso riping server v1.29 o 1.30 me he llevado unos chascos medio raros. En primer lugar las copias resultantes quedan como mal organizadas. Que quiero decir con esto? pues por ejemplo, no quedan como la original, las presentaciones quedan mal, se tarda la lectura, aveces se cuelga, etc. Incluso al tratar la iso con el fstfix, sigue el mismo problema. Esto me ha pasado con juegos como mario kart, mario strikers, los mario party, entre otros.

Mi duda es si aparte de fstfix hay otra utilidad que deba pasarles a las isos, o si hay algo que no he tomado en cuenta para que la iso quede fiel al original y que el cubo me los reciba como debe ser. Gracias ojala me ayuden.